{"id":1184,"date":"2020-12-03T12:51:12","date_gmt":"2020-12-03T12:51:12","guid":{"rendered":"https:\/\/website.prod.unilu.spikeseed.cloud\/fr\/news\/lcsb-sassocie-a-scicrunch-pour-promouvoir-une-recherche-reproductible\/"},"modified":"2020-12-03T12:51:12","modified_gmt":"2020-12-03T12:51:12","slug":"lcsb-sassocie-a-scicrunch-pour-promouvoir-une-recherche-reproductible","status":"publish","type":"news","link":"https:\/\/www.uni.lu\/fr\/news\/lcsb-sassocie-a-scicrunch-pour-promouvoir-une-recherche-reproductible\/","title":{"rendered":"LCSB s’associe \u00e0 SciCrunch pour promouvoir une recherche reproductible"},"content":{"rendered":"

Dans le cadre d’une large initiative visant \u00e0 garantir la qualit\u00e9 et la reproductibilit\u00e9 des r\u00e9sultats scientifiques, le Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB) de l’Universit\u00e9 du Luxembourg s’associe \u00e0 SciCrunch Inc. Le LCSB sera l’un des premiers instituts de recherche \u00e0 utiliser SciScore – un outil de validation automatis\u00e9 des articles scientifiques – dans le cadre de son contr\u00f4le de qualit\u00e9 interne. Ce dernier contribuera \u00e0 renforcer la rigueur et la reproductibilit\u00e9 des articles r\u00e9dig\u00e9s par les chercheurs du LCSB.<\/p>

La recherche scientifique est r\u00e9guli\u00e8rement confront\u00e9e \u00e0 de nouveaux d\u00e9fis. Face au volume croissant de donn\u00e9es, \u00e0 la complexit\u00e9 des nouveaux outils et au rythme rapide de la science moderne, il est indispensable de garantir que les exp\u00e9riences puissent \u00eatre r\u00e9p\u00e9t\u00e9es et les r\u00e9sultats valid\u00e9s. Au cours des derni\u00e8res ann\u00e9es, la communaut\u00e9 scientifique a ainsi reconnu la n\u00e9cessit\u00e9 de travailler sur cette probl\u00e9matique de la reproductibilit\u00e9 afin de garantir la confiance dans la litt\u00e9rature publi\u00e9e et une bonne utilisation des ressources.<\/p>

Le LCSB a tr\u00e8s vite identifi\u00e9 l\u2019importance de ce sujet et mis en \u0153uvre des mesures pour promouvoir la qualit\u00e9 de la recherche. Regroup\u00e9s au sein de l’initiative Recherche Responsable et Reproductible (R3)<\/a>, ces mesures comprennent l\u2019utilisation d\u2019infrastructures informatiques de pointe, une gestion des donn\u00e9es conforme au RGPD et des outils de programmation adapt\u00e9s.<\/p>

\u00ab Un accent particulier a \u00e9t\u00e9 mis sur la standardisation de la proc\u00e9dure de publication, qui sera d\u00e9sormais compl\u00e9t\u00e9e par une v\u00e9rification en amont de la soumission \u00e0 une revue scientifique \u00bb, d\u00e9taille le Dr Christophe Trefois<\/a>, responsable de l’\u00e9quipe R3.<\/p>

Cette \u00e9tape interne permettra d\u2019assurer la conformit\u00e9 et la qualit\u00e9 de tous les manuscrits r\u00e9dig\u00e9s au LCSB, gr\u00e2ce \u00e0 une s\u00e9rie de contr\u00f4les notamment sur le plagiat, la protection des donn\u00e9es et la qualit\u00e9 du code source. SciScore, qui se concentre sur diff\u00e9rents crit\u00e8res de rigueur, sera l’un des principaux composants de cette proc\u00e9dure pr\u00e9publication.<\/p>

\u00ab Une partie des travaux de recherche r\u00e9cents ne peuvent pas \u00eatre reproduits en raison d\u2019erreurs dans les r\u00e9f\u00e9rences, de difficult\u00e9s \u00e0 identifier les sources et d\u2019autres obstacles similaires \u00bb, explique Anita Bandrowski, fondatrice et PDG de SciCrunch<\/a>, la soci\u00e9t\u00e9 qui a d\u00e9velopp\u00e9 SciScore. \u00ab Notre dispositif permet de signaler ces probl\u00e8mes avant que les articles n\u2019int\u00e8grent la litt\u00e9rature scientifique. \u00bb<\/p>

Cet outil de validation automatis\u00e9 v\u00e9rifie diff\u00e9rents crit\u00e8res de rigueur dans les manuscrits ainsi que les ressources mentionn\u00e9es. En parcourant la section m\u00e9thodes d’un article gr\u00e2ce \u00e0 des algorithmes \u2013 on parle de \u00ab\u00a0text mining\u00a0\u00bb \u2013 SciScore d\u00e9tecte si les auteurs ont pris en compte des param\u00e8tres tels que les biais exp\u00e9rimentaux, la taille de l’\u00e9chantillon, les protocoles en double aveugle avec r\u00e9partition al\u00e9atoire, etc. Il analyse \u00e9galement les phrases qui mentionnent les ressources utilis\u00e9es au cours de\u00a0l\u2019\u00e9tude \u2013 comme des anticorps ou des logiciels sp\u00e9cifiques \u2013 et d\u00e9termine si chaque ressource poss\u00e8de un identifiant unique. SciScore effectue cette analyse en environ une minute, g\u00e9n\u00e8re un score permettant d\u2019\u00e9valuer la part de crit\u00e8res remplis et fournit un rapport qui aidera \u00e0 am\u00e9liorer la rigueur et la reproductibilit\u00e9 de l\u2019article.<\/p>

\u00ab Une fois partie int\u00e9grante de la proc\u00e9dure pr\u00e9publication, cet outil permettra aux auteurs du LCSB de mieux pr\u00e9parer leurs manuscrits pour l’\u00e9valuation par les comit\u00e9s de lectures des revues scientifiques \u00bb, souligne Christophe Trefois. SciScore parcourra d’abord une base de donn\u00e9es contenant tous les articles pr\u00e9c\u00e9demment publi\u00e9s au LCSB, donnant ainsi un bon aper\u00e7u de ce qui peut \u00eatre am\u00e9lior\u00e9 en mati\u00e8re de reproductibilit\u00e9 et de transparence. \u00ab Ensuite, lorsque la proc\u00e9dure pr\u00e9publication sera compl\u00e8tement mise en place, nos scientifiques pourront \u00e9valuer leurs nouveaux manuscrits rapidement et avec pr\u00e9cision. \u00bb En indiquant imm\u00e9diatement si quelque chose a \u00e9t\u00e9 omis, SciScore donnera la possibilit\u00e9 aux auteurs de d\u00e9velopper des bonnes pratiques en mati\u00e8re de r\u00e9daction, d\u2019effectuer directement les changements n\u00e9cessaires et de gagner du temps pour d\u2019autres activit\u00e9s.<\/p>

\u00ab La grande majorit\u00e9 de la communaut\u00e9 scientifique reconna\u00eet l\u2019importance d\u2019aller vers une recherche plus reproductible et de nombreuses institutions d\u00e9veloppent des strat\u00e9gies dans ce sens, mais les solutions concr\u00e8tes manquent encore \u00bb, d\u00e9taille le Prof. Rudi Balling, directeur du LCSB. \u00ab Nous en avons fait une priorit\u00e9 au LCSB et nous sommes tr\u00e8s heureux d’\u00eatre le premier centre de recherche \u00e0 ajouter SciScore \u00e0 sa bo\u00eete \u00e0 outils pour promouvoir la qualit\u00e9, la transparence et la reproductibilit\u00e9 de la science.\u00a0\u00bb<\/p><\/div><\/section>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Dans le cadre d’une large initiative visant \u00e0 garantir la qualit\u00e9 et la reproductibilit\u00e9 des r\u00e9sultats scientifiques, le Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB) de l’Universit\u00e9 du Luxembourg s’associe \u00e0 SciCrunch Inc. Le LCSB sera l’un des premiers instituts de recherche \u00e0 utiliser SciScore – un outil de validation automatis\u00e9 des articles scientifiques – dans le cadre de son contr\u00f4le de qualit\u00e9 interne. 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